藍菌門

藍菌門（Cyanophyta）為細菌域·格蘭氏陰性菌（Gram-negative bacteria）的一類族群，又稱：藍菌（學名：Cyanobacteriota，英語：cyanobacteria）、藍細菌、藍綠菌。藍菌舊稱：藍藻（blue algae）或藍綠藻（blue-green algae），擁有：藍藻綱。藍菌門物種（如：藍藻）能透過產氧光合作用將光能轉化為化學能並生產有機物（如：碳水化合物）的自營生物，不過有一些也退化，失去了光合能力只依賴異營獲取生存所需的能量。

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藍藻綱

藍藻綱（Cyanophyceae）是藍菌門的一綱。

  1. 色球藻目（Chroococcales）：
  2. 擬甲色球藻目（Chroococcidiopsidales）：
  3. 束鞘藻目（Coleofasciculales）：
  4. 沙絲藻目（Desertifilales）： 
  5. 蓋絲藻目（Geitlerinematales）： 
  6. 戈芒藻目（Gomontiellales）：
  7. 細鞘絲藻目（Leptolyngbyales）：
  8. 節線藻目（Nodosilineales）：
  9. 念珠藻目（Nostocales）： 
  10. 顫藻目（Oscillatoriales）：
  11. 泥線菌目（Pelonematales）： 
  12. 寬球藻目（Pleurocapsales）：
  13. 原綠絲藍藻目（Prochlorotrichales）：
  14. 假魚腥藻目 （Pseudanabaenales）：
  15. 螺旋藻目（Spirulinales）：
  16. 聚球藻菌目（Synechococcales）： 

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色球藻目

色球藻目（Chroococcales）是藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，物種為有害微生物銅綠微囊藻。這種藻類會出現於使水質惡化時，如：水中懸浮物高居不下、溫度上升、氧氣不足、氨氮濃度升高…等因素。
色球藻目超過 8個科 35屬 250種，絕大多數為淡水產物。

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擬甲色球藻目

擬甲色球藻目（Chroococcidiopsidales）是藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，唯一科：擬甲色球藻科（Chroococcidiopsidaceae）有 8個物種，如：擬甲色球藻 Chroococcidiopsis Geitler…等。

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束鞘藻目

束鞘藻目（Coleofasciculales）是藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有束鞘藻科，如：束鞘藻屬（Coleofasciculus）、蓋絲藻屬（Geitlerinema）…16屬，超過 39 種。

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沙絲藻目

沙絲藻目（Desertifilales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有沙絲藻屬（Desertifilum）…等，5屬 5種。

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蓋絲藻目

蓋絲藻目（Geitlerinematales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，僅有蓋絲藻科·蓋絲藻屬（ Geitlerinema）約 37種，模式種為 Geitlerinema splendidum。

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戈芒藻目

戈芒藻目（Gomontiellales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有管孢藻科（8屬）、藍藻科（1屬 14種）、戈芒藻科（7屬 28種）、Konicacronemataceae…等，4科 

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細鞘絲藻目

細鞘絲藻目（Leptolyngbyales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有細鞘絲藻科（超過 25屬）、新聚球藻菌科（1屬 1種）、Trichocoleaceae…3科。模式屬為細鞘絲藻屬（Leptolyngbya）；模式種為 Leptolyngbya boryana。

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節線藻目

節線藻目（Nodosilineales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有 Cymatolegaceae（23屬）、節線藻科（瘦鞘絲藻屬…等，11屬，超過 50種）…2科。

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念珠藻目

念珠藻目（Nostocales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有束絲藻科、眉藻科、蒴鏈藻科、團毛黏菌科、軟管藻科、節球藻科、念珠藻科、膠鬚藻科、偽枝藻科、真枝藻科、膠聚線藻科、單歧藻科等…15科。 參考物種：水華魚腥藻（Anabaena flos-aquae）。  

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顫藻目

顫藻目（Oscillatoriales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有博氏藻科（5屬，超過 25種）、束鞘藻科（16屬，超過 33種）、藍藻科（1屬 14種）、戈芒藻科（7屬 13種）、鬚藻科（4屬，超過 50種）、微鞘藻科（35屬）、顫藻科（47屬）、席藻科（膠鞘藻屬…等 11屬）、偽魚腥藻科（27屬 ）、裂鬚藻科（裂鬚藻屬…等 5屬 種）…等，超過 12科。

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泥線菌目

泥線菌目（Pelonematales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，僅有泥線菌科，5屬 19種。

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寬球藻目

寬球藻目（Pleurocapsales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，擁有水球藻科（11屬 14種）、寬球藻科、異球藻科…3科。

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原綠絲藍藻目

原綠絲藍藻目（Prochlorotrichales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目。

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假魚腥藻目

假魚腥藻目 （Pseudanabaenales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，唯一科假魚腥藻科 （Pseudanabaenaceae）涵蓋超過 10屬，模式屬：偽魚腥藻屬（Pseudanabaena）。

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螺旋藻目

螺旋藻目（Spirulinales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，原本只有螺旋藻科（Spirulinaceae）一個科，擁有：螺旋藻屬 （Spirulina）…4屬；螺旋藻屬：大螺旋藻 （Spirulina major）…37種。

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聚球藻菌目

聚球藻菌目（Synechococcales）為藍菌門·藍藻綱（Cyanophyceae）的一個目，涵蓋超過 7科；模式屬：聚球藻菌屬（Synechococcus）。

  1. 管孢藻科 （Chamaesiphonaceae）：
  2. 基附異萊包藻科 （Heteroleibleiniaceae）：
  3. 細鞘絲藻科 （Leptolyngbyaceae）：
  4. 平裂藻科 （Merismopediaceae）：
  5. 偽魚腥藻科 （Pseudanabaenaceae）：
  6. 裂須藻科 （Schizotrichaceae）：
  7. 聚球藻菌科 （Synechococcaceae）：

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真核域

真核域（Eukarya）為三域系統（three-domain system）的一個域，擁有所有真核生物（英語：eukaryote）物種。物種的細胞具有細胞核的單細胞和多細胞生物，涵蓋所有動物、植物、真菌和其它擁有由生物膜包裹著的細胞器和複雜亞細胞結構的原生生物。
真核域擁有真核生物也涵蓋原生生物，具有細胞核、細胞質（細胞器、胞質溶膠和各種細胞質內含物）；細胞器具多種膜結構包裹的內膜系統。

  1. 真核生物（英語：eukaryote），如：動物界、植物界、真菌界；
  2. 原生生物（英語：protoctist）是不屬於動物界、植物界與真菌界的所有生物，如：藻類（泛植物）、原核生物（如：細菌、放線菌、古細菌、螺旋體、衣原體、支原體、立克次氏體和藍細菌…等光合性細菌）與原生動物。

〖原核生物〗【main】

原核生物

原核生物（英文：prokaryote）通常由單一原核細胞形成的生物。相對於真核細胞，原核細胞一般沒有細胞內膜、沒有核膜包裹的成型細胞核，細胞內無染色體，DNA鏈未螺旋化，並以游離的形式存在於細胞質中，細胞質內也無任何有膜的細胞器（如：粒線體或葉綠體）。

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原生動物界

原生動物界（Protozoa）是真核域的一個多系群，屬於原生生物當中較接近動物，大多由單細胞所構成，少數是多細胞，又稱：原蟲（英語：protozoan、protozoon）。原生動物（原蟲）大多數是自由生活的食菌生物，有少數生活在其它生物體內營寄生或共生生活，如：眼蟲介於植物和動物之間，能進行光合作用。常見的原生動物：阿米巴原蟲、草履蟲、籃氏賈第鞭毛蟲…等。

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古菌域

古菌域（Archaea）為原核生物，不具有細胞核，如：細菌域。

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分類階元

分類階元（taxonomic rank）是根據物種間演化關係的親疏，為生物學上進行生物分類時確定生物（Organism）共性範圍的上下等級、大小門類，簡稱：階元。 分類階元從最廣泛的域（domain｜領域）到最底層的種（species｜物種）依次採用 7個基本且必要的階元，系統化地分門別類的層級體系（hierarchy）。

7個基本且必要的階元：

界（kingdom）、門（phylum/division）、綱（class）、目（order）、科（family）、屬（genus）、種（species）。

·†·）學術界還常在這些主要階元之間設置「次要階元」，加上前綴（prefix）於階元以資分辨。每個階元的命名（學名）通常以拉丁文表述。
最基層的兩個階元（屬、種）需要被明示以二名法或三名法（亞屬、亞種）之外，其它階元是不被明示的。

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三域系統

三域系統（three-domain system）是由生物學家卡爾·烏斯（Carl Richard Woese｜1928/07/15～2012/12/30）於 1990年發表的生物分類法（Taxonomy），又稱：總域（superkingdom）；依三域特徵區分為三個域（domain、empire、拉丁語：regio）：
古菌域（Archaea）、細菌域（Bacteria）和真核域（Eukarya）。

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域

域（domain、empire、拉丁語：regio）為分類階元最高的分類單元層次。「域」之下分界、門、綱、目、科、屬和種 7個基本必要的階元。參考構造更完善的全部分類。

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界

界（kingdom）曾經是生物科學分類法中最高的類別。近年基於 RNA結構和運作機制的不同，引入了「域」作為生物最高的單元。

  1. 沒有細胞核的細菌成立：細菌域、細菌界；
  2. 真菌也因為沒有葉綠體，被分出植物界，自立為真核域、真菌界；
  3. 最後古細菌也自立為古菌域、古菌界。

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門

門（動物的門為 phylum｜植物和真菌的門為 division）。
目前真核生物的動物界現存 34個門，植物界現存 12個門，真菌界現存約 8個門。

〖亞門〗【top】【main】

綱

綱（class）被作為包容的分類單位，它組合了器官的一個獨特的程度 。「綱」分類法，源於林奈（瑞典語：Carl von Linné｜1707/05/23～1778/0110）所創立的綱、目、屬、種四個階元，也曾經被認為是分類層次結構中的最高級別。

〖亞綱〗【top】【main】

目

目（order）在描述或識別目時，生物分類學家不需要遵循嚴格的規則。

〖亞目〗【top】【main】

科

科（family｜拉丁語：familia）目前生物界約有 800個科。

〖亞科〗【top】【main】

總科

總科（Superfamily｜-acea）介於目和科之間，適用於某些科的動物和植物更進一步歸類。同一個總科涵蓋的族與科具有形態較接近的科。

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族

族（Tribe｜-eae）介於科和屬之間，適用於某些科的動物和植物更進一步分類。同一個族裡涵蓋的屬為同科且物種（Species）的形態（特徵）更接近的屬。

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屬

亞屬、模式屬、

屬（genus）複數：genera。「屬」可用於劃分、歸納現存生物、已滅絕生物以及病毒。在二名法中，「屬名」構成該屬內每個物種的二名法物種名稱的第一部分，而「屬」的首個字母必須大寫。

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模式屬

模式屬（type genus）是生物分類學（biotaxonomy）術語，是一個科的模式種所在屬。同屬物種採用相同拉丁學名的詞根（root word）。

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種

亞種、變種、亞變種、品型、模式種、特有種、

種（species）位於生物分類法中最底級，在屬之下，又稱：物種。

  • 演化生物學家 恩斯特·麥爾（德語：Ernst Walter Mayr｜1904/07/05～2005/02/03）的定義，物種：「能夠相互配育的自然種群的類群，且這些類群與其它的類群在生殖上相互隔離。」
  • 昆蟲學家·陳世驤（1905/11/05～1988/01/25）於 1978年對物種所下定義為：「物種是繁殖單元，由又連續又間斷的居群所組成；物種是進化單元，是生物系統線上的基本環節，是分類的基本單元。」

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亞種

亞種（subspecies；ssp.），生物學·術語，是種以下的一個分類階元。其定義不甚明確，一般認為是同一物種的集群，因為生活在不同地理區域的種群，受所處環境現實的壓力，在基因和形態上發生差異。亞種彼此之間，因地理隔離，但還未發展到產生生殖隔離的程度，謂之：「地理亞種」。
亞種的劃分確立並無統一標準，受學者主觀意志影響頗大。只要種群隔離到一定時間，必然產生差異，但要隔離多少年，差異多大，才能劃為一個亞種，不同學者的觀點可能有很大不同。

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變種

「變種」（varietas；var.）它與原種的區別具較小的變異性，通常僅有一或兩個形態或生理性狀的差異，通常經過多代繁殖後與原種產生若干差異，如：葉色、花色或植株形態上的西許差異。

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亞變種

「亞變種」（subvarietas；subvar.）是在自然狀況與變種相較之下產生更小的變異性，為了兩變種之間些微的差異而做的分類；目前仙人掌科植物很罕見細分至這麼小的分類單位。

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品型

「品型」（forma、form；f., fa.）只是命名單位，不是植物分類學上的分類單位，並不存在野生植物中。品型是人為在園藝栽培過程刻意選擇培育而成的品種，經常會以「園藝品種」（cultivar；cv.）的方式命名。基於「品型」經濟價值的差異作選擇培育「性狀」，如：植株的高矮、花朵或果實的大小、色、香、味，開花期、熟果期…等。品型是園藝栽培的一種變種型態（variant type｜morph），通常僅具一個特定性狀的差異。

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模式種

模式種（type species 或 species typica）為生物分類學術語，指學者建立某個新屬時所依據的種（該屬的載名種），又稱：屬型種、屬模。被指定的種（模式種）代表了該屬的生物學特徵。

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特有種

特有種（endemic species）是指「基於歷史、生態或生理…等因素，造成分佈侷限於某一特定的地理區域，而未在其它地方出現」的物種。

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種群

種群（population）為一定空間範圍內同時生活的同物種自然構成的全部個體，又稱：族群。種群的個體之間享有同一類基因庫（gene pool）能夠確實進行交配（mating）、繁衍（to propagate the species），如：黑人、白人、黃種人皆共享人類的基因庫。

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類群

類群（taxon｜分類單元）為一群擁有共同特徵的生物的集合體，是任何一個等級的具體類群，不同於「分類階元」。分類單元（類群）不包含等級和級序的概念，也有分類階元特定的拉丁學名，大到一個界、一個綱，小到一個屬、一個種乃至一個亞種。

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族群

族群（ethnicity）擁有相同的血緣（祖先認同）、外貌、歷史、文化、習俗（生活習慣）、語言、地域、宗教或國家體驗…等所形成的群體。族群在認知和感情特質上，可能包括「客觀」及「主觀」的成分。族群可能因生物的外貌、行為特徵與時空環境而形成的一群。

〖地球的地質年代〗【top】【main】

生物種群分類法

  1. 被子植物APG III分類法
    （2009年10月正式在林奈學會植物學報發表；於 2016年被 APG IV 取代）；
  2. 阿瑟·約翰·克朗奎斯特
    （Arthur John Cronquist，1919/03/19～1992/03/22）；
  3. 亞美因·塔赫塔江
    （俄語：Армен Леонович Тахтаджян，1910/06/10～2009/11/13）。

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滅絕

絕滅（英語：extinct，縮寫為 EX）是生態學、環境科學的專業用語，又稱：絕種。絕滅用於描述一個物種完全消失的自然結局。

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模式產地

模式產地（type locality）為正模標本（holotype）的採集地點。正模標本又稱：正模式標本、正型標本、正模、正型、主模式…等。
正模標本在理想狀態下是某物種的典型個體；有時正模可能只是物種身體的一部分，如：肱冠多里亞巨龍（Duriatitan humerocristatus｜一種生活在侏羅紀的植食性恐龍）的正模是一塊儲藏在英國自然歷史博物館的肱骨·化石。

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綠藻門

藻類、

綠藻門（Chlorophyta）廣義植物界的一門，擁有約 8’000個物種，大部份都是水生·光合·真核生物。綠藻門植物和有胚植物（現存的陸生植物：苔蘚、維管植物）一樣，含有葉綠素 a 和 b ，且將能源轉化為澱粉存在其色素體內。綠藻門、輪藻門與有胚植物一起合稱為綠色植物。
綠藻門植物涵蓋：單細胞和多細胞的物種，大部份物種生活在淡水裡，其他許多物種則居住在海水中，另外還有一些物種適應了許多的環境，如：極地雪藻（西瓜雪）居住在夏天的高山雪原中；還有依附在岩石或樹木上頭的；有些綠藻、真菌和地衣有共生關係；綠藻門中的藻類也會和原生動物、海綿及刺胞動物…等形成共生關係。有些綠藻門植物會有鞭毛以利於移動，有些會行「同配」或「異配」生殖…等有性生殖。

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藻類

藻類（algae）為真核域的子類群，泛指所有行光合自營非狹義的植物的真核域生物；是一類原始色素體生物（Archaeplastida｜廣義的植物），有異於原核生物（如：革蘭氏陰性菌）藍綠藻門的藍綠菌（cyanobacteria｜藍菌）。

·†·）藻類生物質燃料（algal biofuel）是以藻（algae）作原料製成可以替代石化燃料的生物燃料。多國政府及私人公司已經投入資金研究減少其成本以使其能作商業應用。藻類燃料在燃燒時與石化燃料一樣會產生二氧化碳，但藻類在生長期間已在自然界吸收了二氧化碳，所以「相對的」能達至減排二氧化碳的效果。
§ How microalgae can treat wastewater and turn it into a valuable resource
https://youtu.be/oj6NSp-AJrw （2019/08/26）

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綠菌門

綠菌門（Chlorobi）為細菌域的一個門，沒有近親，最近的類群爲擬桿菌門（Bacteroidota）。綠菌門物種是一類進行不產氧光合作用的細菌。
綠菌綱（Chlorobia）為綠菌門的一個綱，擁有唯一目：綠菌目（Chlorobiales）；唯一科：綠菌科 （Chlorobiaceae）。

〖綠藻門〗【main】

綠菌科

綠菌科 （Chlorobiaceae），為細菌域·革蘭氏陰性菌（纖維桿菌門）綠菌門的唯一科，又稱：綠色硫細菌科。綠菌科物種的細胞球形、卵形、直或彎曲的杆形；二分裂或三分裂繁殖；從顏色上可清楚地分成兩群：綠色（草綠色）或棕色（巧克力色）。
綠色硫細菌存在於含有硫化物的各種水環境中，如：溝壕、池塘、湖泊、河流、硫泉、港灣及其它海洋生境。

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線蟲草科

線蟲草科（Ophiocordycipitaceae）是真菌界·子囊菌門·糞殼菌綱·肉座菌目下的一個科，已紀錄有 7個屬：

  1. 被毛孢屬 （Hirsutella）：
    長白山被毛孢     （Hirsutella changbeishanensis）…超過 26種；
  2. 層束梗孢屬 （Hymenostilbe）：
    雙翅目層束梗孢     （Hymenostilbe dipterigena）…超過 4種；
  3. 線蟲草屬 （Ophiocordyceps）：
    高原線蟲草     （Ophiocordyceps highlandensis）、冬蟲夏草 （Ophiocordyceps sinensis）…約 140種； 
  4. 多年蟲草屬 （Perennicordyceps）：
    多年生冬蟲夏草    …約 6種；
  5. 多頭霉屬 （Polycephalomyces）：
    菇形多頭霉     （Polycephalomyces agaricus）…約 10種；
  6. 紫孢霉屬 （Purpureocillium）：
    淡紫紫孢菌     （Purpureocillium lilacinum）…不僅 1種； 
  7. 彎頸霉屬 （Tolypocladium）：
    膨大彎頸霉     （Tolypocladium niveum）、大團囊彎頸霉 （Tolypocladium ophioglossoides）…超過 15種。

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冬蟲夏草

冬蟲夏草（Ophiocordyceps sinensis）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·糞殼菌綱 ·肉座菌目·線蟲草科·線蟲草屬（約 140種）的一種寄生於昆蟲的真菌，通常寄生於鱗翅目·蝙蝠蛾科部分昆蟲幼蟲體內生長。

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