脊椎動物亞門（Vertebrata）為脊索動物門（Chordata）·嗅球類（Olfactores）的一個亞門，又稱：有頭動物（Craniata），現存 73’500餘種。涵蓋：
分類
脊椎動物亞門的動物的脊椎都包在骨頭裡面，是脊索動物門中最大和最多樣化的亞門。脊索動物門先後經過頭索動物和尾索動物，最後出現脊椎和頭部。脊椎動物包括魚類、兩棲動物、爬行動物、鳥類和哺乳動物等五大類。目前所知最早的脊椎動物是中國雲南省昆明發現的†豐嬌昆明魚，距今約 520’000’000年前。
脊椎動物亞門的成員擁有：
魚類
魚類（fishes）共通的特徵是有鰓的水生動物，缺乏四肢及肢末端的指，且皮膚表層含有細毛。絕大部份的魚類屬於變溫動物，其體溫會隨外在環境溫度而變化。根據已故加拿大學者約瑟夫·納爾遜（1994年）統計，全球當時已知魚類約有28‘000種，占已命名脊椎動物一半以上，且新種魚類不斷被發現。目前全球已命名的魚種約在 32’100種。
詳見：〖魚類分類表〗、〖臺灣魚類名錄〗。
在科學的分類法中，例如人類、恐龍等在系統發生學上的確是屬於硬骨魚的一部分，嚴格上把陸地脊椎動物叫做「魚」並無科學上的瑕疵。
兩棲類
兩棲類為兩棲綱生物（Amphibia）是兩棲動物的通稱，又名兩生動物，包括所有沒有卵殼的卵，擁有四肢的脊椎動物（蚓螈的四肢已退化）。兩棲動物的皮膚裸露，表面沒有鱗片、毛髮等覆蓋，但是可以分泌黏液以保持身體的濕潤；其幼體在水中生活，用鰓進行呼吸，長大後用肺兼皮膚呼吸。兩棲動物可以爬上陸地，但是不能一生離水，因為可以在兩處生存，稱為兩棲。牠是脊椎動物從水棲到陸棲的過渡類型。現在大約有七千多種兩棲動物。兩棲動物是冷血動物（冷血動物也就是變溫動物）。兩棲動物都是食肉的，一般以蠕蟲、蜘蛛和昆蟲為食。較大一點的兩棲動物還以小的爬行動物、哺乳動物甚至螃蟹為食物。
爬行類
爬行類為爬行綱（Reptilia）動物通稱，又名爬蟲類、爬行動物，是一類脊椎動物，屬於四足總綱的羊膜動物，是包括了龜、蛇、蜥蜴、鱷、鳥類及史前恐龍…等物種。除了鳥類歸類於鳥綱，其他現存的爬行動物涵蓋： 4個目。
＃）根據親緣分支分類法，鱷魚與鳥類的關係更親近，因此，現代爬行動物必須包含鳥類才能組合成單系群，再與合弓綱組成單系群羊膜動物。
鳥類
- 鷉形目（鷿鷈目）、
- 鸛形目、
- 鴴形目、
- 鸚形目、
- 夜鷹目、
- 咬鵑目、
- 犀鳥目、
- 企鵝目、
- 鸌形目、
- 隼形目、
- 鷹形目、
- 鴿形目、
- 雁形目、
- 雞形目、
- 鵑形目、
- 雨燕目、
- 佛法僧目、
- 鵑鴗目、
- 潛鳥目、
- 鰹鳥目、
- 鵜形目、
- 鶴形目（紅鶴目）、
- 雀形目、
- 鴞形目、
- 鼠鳥目、
- 鴷形目、
- 麝雉目、
- 叫鶴目。
鳥類為鳥綱動物的通稱，依據目前鳥綱·今鳥亞綱·今顎類（今鶚總目）·的分法有三類：古顎下綱、雞雁小綱與新鳥小綱，總共有 32目 94科 305屬。
- 古顎下綱（5目）：無翼鳥目、鶴鴕目、美洲鴕鳥目、鴕鳥目、䳍形目。
- 雞雁小綱（2目）：雁形目、雞形目。
- 新鳥小綱（25目）：鷿鷈目、鸛形目、鴴形目、鸚形目、夜鷹目、咬鵑目、犀鳥目、企鵝目、鸌形目、隼形目、鴿形目、鵑形目、雨燕目、佛法僧目、鵑鴗目、潛鳥目、鰹鳥目、鵜形目、鶴形目、雀形目、鴞形目、鼠鳥目、鴷形目、麝雉目、叫鶴目。
哺乳類
食肉目：犬科、熊科、小熊貓科、臭鼬科、浣熊科、鼬科、雙斑狸科、林狸科、貓科、靈貓科、鬣狗科、食蟻狸科、獴科、
哺乳類為哺乳動物的通稱，是指脊椎動物亞門下哺乳綱（Mammalia）的一類用肺呼吸空氣的溫血脊椎動物，因能通過乳腺分泌乳汁來給幼體哺乳而得名。哺乳動物的身體結構複雜，有區別於其他類群的大腦結構、恆溫系統和循環系統，具有為後代哺乳、大多數屬於胎生、具有毛囊和汗腺等共通的外在特徵。 它們外型多樣，小至體長 30毫米長有翅膀的凹臉蝠，大至體長 33米形同魚類的藍鯨。它們有很好的環境適應能力，分布在從海洋到高山，從熱帶到極地的廣泛區域。人類也是哺乳動物的一員。哺乳動物分為 2個亞綱：原獸亞綱（包含卵生的單孔目動物）、獸亞綱（包含胎生的有袋類及胎盤類動物）。
哺乳動物簡稱「獸」，古生物學上，已滅絕的哺乳動物譯名常帶「獸」字，如爪獸、雷獸、中獸、海獸（海生或生長在海邊的哺乳動物）⋯⋯等。除了哺乳類，有人發現蜘蛛和蟑螂亦能產奶。
脊索動物門
- 頭索動物亞門
- 被囊動物亞門（尾索動物）
脊索動物門（Chordata）是動物界中生態位處於最頂端的一門，此類動物具有脊索，或在演化過程中退化而被脊椎取代。脊索動物現存約 66’000種，為動物界第三大門，物種多樣性僅次於節肢動物門和軟體動物門。現分為頭索動物、被囊動物（舊稱尾索動物）、脊椎動物和古蟲動物（已滅絕）4個亞門，其中以脊椎動物種類最多且身體構造最為複雜完善。少數學者提出將半索動物門也置於脊索動物門下，並命名為口索動物亞門。
頭索動物
頭索動物（Cephalochordata）是脊索動物門的一個亞門。頭索動物的脊索延伸到背神經管的前方。頭索動物的咽鰓裂眾多。頭索動物一般稱為文昌魚，故又名狹心綱及文昌魚綱。因無真正的頭部，又稱為無頭類（Acrania）。如：文昌魚科的白氏文昌魚（Branchiostoma belcheri）。
被囊動物
被囊動物亞門（Tunicata），舊稱：尾索動物亞門（Urochordata），是脊索動物門的一個亞門。本綱動物脊索和背神經管僅存於幼體尾部，成體退化消失。身體表面披有一層棕褐色植物性纖維質的囊包，裡面再有一層外套膜包裹。全部是海洋動物。常見種類有各種海鞘和住囊蟲，營自由生活或固著生活。有些種類有世代交替現象。