菌物總界

真菌界、核形蟲界、

• 核形蟲綱（Cristidiscoidea） 
  • 泉生蟲目（英語：Fonticulida）
  • 核形蟲目（Nucleariida）
• 動孢菌（英語：Zoosporia）
  • 後孢菌（英語：Opisthosporidia） 
    1. Aphelida（英語：Aphelida） 
    2. LCNC1 
    3. 羅茲菌門（Rozellomycota）舊稱：隱真菌門（Cryptomycota）
       • 羅茲菌（英語：Rozellida） 
       • Namako-37 
       • 微孢子蟲綱（Microsporidia）
  • 真菌界（Fungi｜狹義）
    1. 擔子菌門 
       • 柄鏽菌亞門 
       • Orthomycotina 
         • 黑粉菌亞門（Ustilaginomycotina） 
         • 傘菌亞門（Agaricomycotina）
           • 銀耳綱（Tremellomycetes）
           • 花耳綱（Dacrymycetes）
           • 傘菌綱（Agaricomycetes）
    2. 子囊菌門 
       • 外囊菌亞門（Taphrinomycotina） 
       • 酵母菌類（Saccharomycetes）

菌物總界包含真菌界（Fungi）與核形蟲目（Nucleariida）的最小包容支。
細胞生物是原核細胞生物與真核細胞生物，牠們的多樣性衍生成的單細胞生物，如細菌（Bacteria）和原生動物（Protozoa），以及在多細胞生物如人類、植物和海綿的許多專門的細胞。

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真菌界

真菌界：酵母、黴菌、菇類、

真菌又稱菌物界，是真核生物中的一大類群，包含酵母、黴菌之類的微生物以及為人熟知的菇類。廣泛分布於全世界的各種棲地與其它生物共生，包括氣候極端的環境如沙漠、深海以及受輻射污染的地區，有些種類對輻射的抗性極強，某些地衣甚至可以抵擋高強度的宇宙射線與紫外線，在人造衛星上的研究站存活。大多數真菌生長在陸地上，但有些真菌生活史的部分或全部階段生長於水中。真菌存在於地球上幾乎所有環境中，真菌與細菌同為許多生態系中的分解者，在生物地球化學循環與食物鏈中扮演重要角色。真菌將有機物分解成二氧化碳釋放，使碳元素重新回到食物鏈中，且作為腐生生物，真菌可將氮元素從有機物中分解釋放，對氮循環不可或缺。

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核形蟲界

Nuclearia、Micronuclearia、

核形蟲與動物、真菌以及其它一些小類群同屬後鞭毛生物。後續研究顯示核形蟲是真菌的姊妹群。2018年，Tedersoo 將核形蟲獨立劃分為『核形蟲界（Nucleariae）』，囊括核形蟲門（Nuclearida）及泉生蟲門（Fonticulida）。核形蟲通常很小，最大約 50微米。
核形蟲是原生生物的一種，具有絲狀偽足，生活在土壤和淡水裡。它們與同樣具有絲狀偽足的 vampyrellid 形態上非常相似，可以通過粒線體的盤狀嵴來鑑別。

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