黴菌（mold、mould、mildew）不是分類學名詞，是「菌絲體發達、不產生大型肉質子實體的絲狀真菌（filamentous fungus）」的俗稱。
黴菌的菌絲（hypha）呈長管、分枝狀，無橫隔壁，具多個細胞核，並會聚成菌絲體（mycelium）。黴菌常用孢子的顏色來稱呼，如：黑黴菌、紅黴菌或青黴菌。黴菌的繁殖方式包括：無性生殖、有性生殖和特別方式。
- 人類所發現最早在第二次世界大戰期間所研發出的抗生素－即為盤尼西林，就是由青黴菌所製造。
- 有些黴菌也被刻意培殖來用於食物的生產，例如：藍起司是歐洲人經由發酵後再加入青黴菌所製成的；醬油、豆瓣醬、豆豉和味噌等需要米麴菌發酵；紅糟、豆腐乳和紅露酒等則是由紅麴菌所發酵製造；發酵臭豆腐的臭滷水也含有多種菌種。
真菌界擁有 8個亞界與 3種生態：
黑黴菌
黑黴菌（Meliolales｜小煤炭菌目）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·糞殼菌綱（14目）·小煤炭菌目（Meliolales）·小煤炭菌科（Meliolaceae｜唯一科）·小煤炭菌屬（Meliola｜小煤炱屬）的一種真菌，如：山茶生小煤炱…等數百種。
青黴菌
青黴菌屬（Penicillium）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·散囊菌綱·散囊菌目·毛刷囊菌科已紀錄 9屬中的一屬。青黴屬（Penicillium）物種呈筆狀的筆狀體（penicillus）構造，尖端上帶有孢子。青黴菌的孢子肉眼可見的顏色為藍綠色，也有白色或者綠色，如：產黃青黴菌（Penicillium chrysogenum）、義大利青黴（Penicillium italicum）…等數百種。冬季和春季是青黴菌的生長巔峰期。
弗萊明（Sir Alexander Fleming｜1881/08/06～1955/03/11）於 1928年在實驗室中發現特異青黴菌（Penicillium Notatum）具有殺菌作用。
1938年由牛津大學領導團隊提煉出青黴素（penicillin），從而改變了人類與傳染病之間生死搏鬥的歷史。青黴素是人類最早發現的抗生素（antibiotic）。
·†·）對於青黴素過敏的個體，使用紅黴素（erythromycin）通常屬於安全的。
紅麴菌
紅麴菌（Monascus purpureus）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·散囊菌綱·散囊菌目·紅麴科·紅麴菌屬（Monascus）的一種紅色黴菌，中國古稱：丹麴。丹麴是一種將紅麴菌接種在蒸熟的大米上，經發酵加工的米，可用於發酵、防腐、食物上色…等功能，又稱：紅麴米。紅麴米是一種天然的食品添加劑，可用來製作紅麴酒和紅糟。
紅麴菌適當生長的溫度為 25℃~40℃，生長最快速、色素最多的溫度為 35℃~37℃。桔黴素（Citrinin）是紅麴菌產生真菌毒素，於 1995年被法國Dr. Blanc證實可引起實驗動物的腎臟腫大、尿量增多，腎小管擴張和上皮細胞變性壞死等症狀。不過桔黴素的生成與否、含量有關為紅麴菌種、培養條件、精製工藝…等因素。
黃麴黴
黃麴黴（Aspergillus flavus）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·散囊菌綱·散囊菌目·麯菌科·麴黴屬（Aspergillus）的一種腐生真菌。在自然環境中，人類常見的麴黴病約有 15%由黃麴黴引起，有時候也會引起角膜、耳與鼻、眼框的感染。
米麴菌
米麴菌（Aspergillus oryzae）為真菌界·子囊菌門·盤菌亞門·散囊菌綱·散囊菌目·麯菌科·麴黴屬（Aspergillus）的一種帶有菌絲（hypha）的真菌與黴菌，又稱：米麴霉、麴黴菌或麯黴菌；日文：麹菌。日本將米麴菌認定為日本的「國菌」。
目前認為米麴菌應屬於黃麴黴（Aspergillus flavus）的一個亞群。 米麴菌經常被用來發酵·大豆用來製作醬油、味噌與甜麵醬。米麴菌也被用於糖化（saccharify）稻米、馬鈴薯、麥…等糧食用來發酵以製作米醋（rice vinegars）與酒類，如：黃酒、日本酒（清酒、泡盛與燒酎）…等。