翼手目

• 陰翼手亞目：
• 陽翼手亞目：

翼手目（Chiroptera）物種的通稱為蝙蝠，又稱：蟙䘃（ㄓˊ ㄇㄛˋ）是哺乳動物中唯一具有飛行能力的類群，也是多種害蟲的主要天敵，更是人畜共患病·病原體的天然宿主。翼手目擁有 21科 234屬 1’399種，是哺乳動物，僅次於齧齒目的第二大類群。翼手目（如：蝙蝠…等）、齧齒目（如：老鼠、豪豬、海狸、水豚…等）和真盲缺目·鼩形亞目（如：猬科、†島鼯科、溝齒鼩科、鼩鼱科、鼴科）是哺乳動物中，類群最多的目。翼手目涵蓋 2亞目：陰翼手亞目 （Yinpterochiroptera）如：狐蝠科；陽翼手亞目（Yangochiroptera）如：蝙蝠科。

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陰翼手亞目

陰翼手亞目 （Yinpterochiroptera）依據研究人員以建構出分子鐘研究轉錄組資訊估計陰翼手亞目與陽翼手亞目約於 63’000’000年前分家；而陰翼手亞目中的菊頭蝠總科與狐蝠總科，則約於 60’000’000年前分家。

1. 狐蝠總科（Pteropodoidae）： 
   • 狐蝠科（Pteropodidae）：
2. 菊頭蝠總科（Rhinolophoidea）：
   • 凹臉蝠科（Craseonycteridae）：
   • 蹄蝠科（Hipposideridae）：
   • 假吸血蝠科（Megadermatidae）：
   • 菊頭蝠科（Rhinolophidae）：
   • 鼠尾蝠科（Rhinopomatidae）：

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陽翼手亞目

陽翼手亞目（Yangochiroptera）涵蓋狐蝠總科與菊頭蝠總科之外的小蝙蝠。

1. 鞘尾蝠總科（Emballonuroidea）： 
   • 鞘尾蝠科（Emballonuridae）：
   • 夜凹臉蝠科（Nycteridae）：
2. 兔唇蝠總科（Noctilionoidea）： 
   • 煙蝠科（Furipteridae）：
   • 髯蝠科（Mormoopidae）：
   • 短尾蝠科（Mystacinidae）：
   • 吸足蝠科（Myzopodidae）：
   • 兔唇蝠科（Noctilionidae）：
   • 葉口蝠科（Phyllostomidae）：
   • 盤翼蝠科（Thyropteridae）：
3. 蝙蝠總科（Vespertilionoidea）： 
   • 大頭蝠科（Cistugidae）：
   • 長翼蝠科（Miniopteridae）：
   • 犬吻蝠科（Molossidae）：
   • 長腿蝠科（Natalidae）：
   • 蝙蝠科（Vespertilionidae）：

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